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植物DNA甲基转移酶的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 吴春太 1 ; 李维国 1 ; 高新生 1 ; 张晓飞 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院

关键词： DNA甲基转移酶;生物信息学;DNA甲基化

期刊名称： 西南大学学报(自然科学版)

ISSN： 1673-9868

年卷期： 2010 年 32 卷 04 期

页码： 83-89

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 运用生物信息学的方法和软件对油棕、桃树、豌豆、胡萝卜、拟南芥等植物的DNA甲基转移酶的核酸及其氨基酸序列进行了组成成分、理化性质、同源性比对分析,进而对其信号肽、跨膜结构域、疏水性和亲水性、蛋白质二级及三级结构、分子系统进化等重要参数进行预测和推断.结果表明:DNMT的全长cDNA包括5非翻译区、一个开放阅读框和3非翻译区,该蛋白无信号肽和蛋白转运肽,是一个亲水性蛋白,具有两个BAH和一个DNA甲基化酶结构域,其二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主要结构元件,各个结构域之间可以依靠静电作用依次结合.

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