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菜用大豆蔗糖转运蛋白基因Glyma18g15950的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张玉梅 1 ; 胡润芳 1 ; 林国强 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院作物研究所/福建省特色旱作物品种选育工程技术研究中心

关键词： 菜用大豆;Glyma18g15950;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2019 年 23 期

页码： 29-34

摘要： 为了从分子水平上揭示菜用大豆蔗糖转运蛋白的结构特点,研究从菜用大豆‘闽豆6号’中同源克隆了蔗糖转运蛋白基因Glyma18g15950。经测序发现:该基因CDS长度为1794 bp,编码一个含有597个氨基酸的多肽。生物信息学分析表明,Glyma18g15950蛋白的等电点(pI)为5.81,分子量(Mw)为64.30 kD;为疏水性蛋白。SOMPA分析表明,各个氨基酸残基对应的二级结构分别为α螺旋42.47%、β折叠13.71%、无规则卷曲39.63%和β转角4.18%;氨基酸序列和结构分析显示Glyma18g15950蛋白包含MFS_2结构域。SignalP分析表明该蛋白没有信号肽。系统进化树分析表明菜用大豆Glyma18g15950蛋白与野生大豆(Glycine soja)的亲缘关系最近,同源性达97.34%。将该蛋白与拟南芥的9个SUC蛋白比对表明Glyma18g15950与AtSUC3的亲缘关系最近,属于SUT2亚族。

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