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玫瑰GASA4-like基因的克隆及其序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张强 1 ; 孟月娥 1 ; 李艳敏 1 ; 王慧娟 1 ; 王利民 1 ; 王志勇 1 ;

作者机构: 1.河南省农业科学院园艺研究所

关键词: 玫瑰;GASA4-like;克隆;序列分析

期刊名称: 河南农业科学

ISSN: 1004-3268

年卷期: 2009 年 09 期

页码: 161-166

收录情况: 北大核心

摘要: 从大马士革玫瑰(Rosa damascena)中利用同源克隆结合RACE的方法首次获得了一个GASA4-like基因的cDNA和DNA序列全长(GenBank登陆号FJ595792,FJ595793),并利用TAIL-PCR的方法克隆了其部分启动子序列。结果表明,玫瑰GASA4-like基因包含4个外显子,3个内含子,开放阅读框为327bp,编码108个氨基酸序列。对推导的氨基酸序列分析发现,N末端1~26个氨基酸是一信号肽序列,C末端含有12个保守的半胱氨酸残基,具有GASA基因家族共同的一些结构特征。系统进化分析表明,玫瑰GASA4-like与分生组织中表达的GASA蛋白聚为一类。启动子顺式作用调控元件分析表明,GASA4-like基因上游318bp的部分启动子含有诱导表达调控元件和一些转录因子的结合位点;最后,对GASA4-like基因可能的生物学功能进行了预测。

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