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利用DNA池和测序技术快速筛查候选效应单倍型

文献类型： 中文期刊

作者： 杜红丽 1 ; 崔建勋 2 ; 张细权 3 ;

作者机构： 1.华南理工大学生物科学与工程学院

2.广东省农业科学院科技情报研究所

3.华南农业大学动物科学学院

关键词： DNA池;测序;单倍型

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1006-1304

年卷期： 2008 年 16 卷 02 期

页码： 281-285

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 选取产蛋性能具有明显差异的4个鸡(Gallus gallus)品种(莱航鸡、阳山鸡、丝羽乌骨鸡和隐性白洛克鸡)构建品种DNA池,通过测序研究鸡催乳素基因5'-侧翼调控区部分序列(1028bp)的单倍型,快速筛查到由4个单核苷酸多态性(SNP)位点(C-2402T、C-2161G、C-2062G和G-2040A)组成的2种最常见单倍型CCCG和TGGA,其中CCCG在莱航鸡品种中的频率接近1,可能利于产蛋。再利用RFLP和SSCP将这4个位点在品种及家系中进行基因分型,基因分型之后的统计结果与测序的结果基本相符。利用农大褐×泰和丝羽乌骨鸡家系检测CCCG单倍型的效应,发现含有此单倍型的单倍型组合具有更高的产蛋量。由6个位点组成的单倍型H3(CCTCTG,由CCCG再加上T-2101和T-2054组成)在莱航鸡的频率为1,在参考家系中检测H3的效应,发现含有H3的单倍型组合具有很高的产蛋量,并且与其它类型达到显著性差异。从研究可见,利用这种方法能有效地筛查到可能的效应单倍型。

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