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水稻颖壳扭曲基因TWH1的精细定位和候选基因分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李进波 1 ; 戚华雄 2 ;

作者机构: 1.湖北省农业科学院粮食作物研究所/粮食作物种质创新与遗传改良湖北省重点实验室

2.;湖北省农业科学院粮食作物研究所/粮食作物种质创新与遗传改良湖北省重点实验室;

关键词: 水稻(Oryza sativa L.);颖壳扭曲突变体;精细定位;候选基因

期刊名称: 湖北农业科学

ISSN: 0439-8114

年卷期: 2017 年 24 期

页码: 4907-4911

摘要: 在育种后代材料中发现1株水稻(Oryza sativa L.)颖壳扭曲突变体P303,遗传分析表明,突变体表型受1对隐形基因控制。根据TWH1基因的初步定位结果,利用F2定位群体对该基因进行精细定位。结果表明,TWH1基因被定位在RM14148和RM14167之间的0.6 c M区间。通过在目标区间设计SSR引物,TWH1基因最终被定位在SSR标记RML25和RML35之间,物理距离为11.9 kb。基因注释表明在该区间只有1个候选基因LOC_Os02g56610,该基因编码一个包含DUF640结构域、全长248氨基酸残基的蛋白质。序列分析表明,突变体在该基因第二个内含子区域发生了17个碱基的缺失,从而导致开放阅读框的改变。

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