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萝卜属抽薹开花相关基因FLC的预测及分析

文献类型: 中文期刊

作者: 郭军 1 ; 祖艳侠 1 ; 吴永成 1 ; 郑佳秋 1 ; 梅燚 1 ;

作者机构: 1.江苏沿海地区农业科学研究所

关键词: 十字花科;萝卜属;开花时间基因

期刊名称: 浙江农业学报

ISSN: 1004-1524

年卷期: 2014 年 26 卷 03 期

页码: 656-660

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以控制拟南芥春化途径的关键基因FLC全长CDS为参考序列,在萝卜属(Raphanus)EST数据库中进行BLASTN检索,得到具备Score≥100、E-value≤10-10和coverage≥70%条件的70条萝卜ESTs作为候选的拟南芥FLC基因的同源ESTs,并进行序列聚类拼接、注释及分析。结果显示:在普通萝卜和野生萝卜中各发现两个旁系同源基因(RsFLCa和RsFLCb及RrFLCa和RrFLCb)。RFLCs与拟南芥FLC间在核酸水平上的一致性为78.7%~86.9%;RFLCs旁系同源基因间的一致性为75.9%~93.4%;RFLCs与芸薹属FLC直系同源基因间的一致性绝大多数维持在85%以上,且高于与拟南芥直系同源基因间的一致性。系统进化分析发现,与白菜、甘蓝及甘蓝型油菜中FLC多拷贝产生的机制可能类似,萝卜属FLC基因的多拷贝现象可能也是伴随萝卜基因组的多倍化而产生的。

  • 相关文献

[1]萝卜硫苷生物合成相关基因RsFMO_(GS-OXs)的预测及分析. 王辉,郭军,梅燚,祖艳侠,吴永成,郑佳秋. 2014

[2]十字花科根肿病研究现状及展望. 杜艳,刘邮洲,李建斌,乔俊卿,王神云,梁雪杰. 2014

[3]十字花科根肿病研究进展. 索欢,陈龙正,徐海,宋波,樊小雪,袁希汉,何长征. 2015

[4]叶用萝卜育种现状及发展趋势. 王成,王辉,苏小俊. 2012

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