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花生荚果发育过程中的microRNA鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 胡冬秀 1 ; 刘浩 1 ; 洪彦彬 1 ; 梁炫强 1 ; 陈小平 1 ;

作者机构： 1.广东省农作物遗传改良重点实验室/国家油料作物改良中心南方分中心/广东省农业科学院作物研究所

关键词： 花生;荚果发育;small RNA测序;microRNA;靶基因

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2021 年 47 卷 004 期

页码： 613-625

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 花生(Arachis hypogaea L.)是典型"地上开花、地下结果"的作物,为从转录后调控水平解析此独特的果实发育现象,本文应用small RNA测序技术研究荚果发育11个时期果壳及种子中的microRNA及其靶基因.通过测序分别获得212个已知的microRNA和112个新microRNA,其中,已知microRNA包括197个保守microRNA和15个花生特异microRNA,新microRNA来自62个新的microRNA前体序列.表达分析发现,67个microRNA及其靶基因在荚果发育的11个时期存在时空特异性表达,部分microRNA的表达量积累阶段性调节果壳与种子的发育,表明microRNA参与了花生荚果暗发育的整个过程.此外,对28个microRNA与30个靶基因进行荧光定量PCR验证发现,microRNA和靶基因的表达趋势与测序结果基本一致.本研究通过对花生荚果不同发育时期的果壳和种子进行small RNA测序,鉴定参与调控花生荚果膨大相关的microRNA,为研究黑暗条件下植物果实发育的调控机制与花生遗传改良奠定理论基础.

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