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木薯SYP基因的序列特征及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李文绮 1 ; 阮孟斌 2 ; 王斌 2 ; 赵平娟 2 ; 彭明 1 ;

作者机构： 1.石河子大学生命科学学院农业生物技术重点实验室

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所/农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室

关键词： 木薯;SYP基因;进化树;基因表达

期刊名称： 植物学报

ISSN： 1674-3466

年卷期： 2014 年 49 卷 01 期

页码： 63-77

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 植物突触融合蛋白(SYP)是一类与植物细胞内囊泡介导转运有关的蛋白。部分SYP基因与植物对生物和非生物胁迫的响应有关。该文利用生物信息学工具分析了木薯(Manihot esculenta)SYP基因及其蛋白结构、核苷酸多态性和系统进化关系,并利用RT-PCR技术检测了木薯不同组织中SYP基因的表达。结果表明,木薯SYP基因及其蛋白结构均具有明显的规律性和家族成员间的保守性;SYP基因的cDNA在基因间以及不同品种间具高度一致性,核苷酸变异以同义替换为主。进化分析表明,植物SYP基因可分为2个亚家族,木薯SYP基因倾向于与蓖麻(Ricinus communis)SYP基因聚在进化树同一分支的末端。半定量RT-PCR分析表明,5个木薯SYP家族成员具有组织特异性。上述研究结果为木薯SYP基因功能研究和功能单核苷酸标记的开发奠定了重要基础。

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