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火龙果热激转录因子HSF基因家族鉴定及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 邓健炜 1 ; 孙清明 2 ; 申迎宾 1 ; 李俊成 2 ;

作者机构: 1.广州大学生命科学学院

2.广东省农业科学院果树研究所/农业农村部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室/广东省果树科学与技术研究重点实验室

关键词: 火龙果;HSF基因家族;热激转录因子;生物信息学

期刊名称: 福建农业学报

ISSN: 1008-0384

年卷期: 2025 年 40 卷 003 期

页码: 280-290

摘要: 【目的】探究火龙果(Selenicereus spp.)热激转录因子(heat shock transcription factors, HSF)基因家族的生物学特性,为探明火龙果抵抗高温胁迫反应机制提供依据。【方法】运用生物信息学手段,对火龙果HSF基因家族进行理化性质、Motif分析、基因结构分析、基因结构域的预测、染色体定位、启动子分析和系统进化树分析等。并通过转录组数据和qPCR技术分析基因家族各成员在逆境胁迫的表达情况。【结果】从火龙果基因组中鉴定出13个HSF基因家族成员。理化性质分析结果表明,其编码的热转录因子均为不稳定蛋白;基因结构分析显示,火龙果HSF基因家族大部分成员仅含一个内含子;系统进化树分析结果表明,火龙果HSF基因家族根据亲缘关系分为4类,Motif分析结果也从侧面印证同一分支的基因具有相似或相同的保守基序;HSF基因家族成员随机分布在火龙果的6条染色体中;其启动子中包含激素响应、逆境胁迫、植物生长发育调控和光响应等多种元件;基因结构域预测分析发现,火龙果HSF基因家族成员均含有特定的HSF结构域。基因表达分析表明,火龙果HSF基因的表达具有较强的时间与空间特异性;其中仅5个成员在枝条表达且表达趋势不同,HU05G00210.1和HU05G01887.1的表达量在24 h和48 h均显著升高,HU02G02398.1和HU10G01257.1在经过48 h高温处理后表达量才显著升高,而HU04G00163.1表达量则没有显著变化,体现了HSF基因对热胁迫的响应。【结论】初步鉴定并验证了HSF基因家族成员参与了火龙果热胁迫反应过程,为进一步探究HSF基因家族成员在火龙果高温响应机制提供参考。

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