文献类型： 中文期刊
作者： 刘芳 1 ; 庹德财 2 ; 沈文涛 2 ; 言普 2 ; 黎小瑛 2 ; 周鹏 2 ;
作者机构： 1.海南大学环境与植物保护学院
2.海南大学环境与植物保护学院;中国热带农业科学院热带生物技术研究所
关键词： 混合感染;PRSV;PLDMV;序列分析;绝对定量
期刊名称： 热带作物学报
ISSN： 1000-2561
年卷期： 2016 年 37 卷 04 期
页码： 742-751
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 番木瓜环斑病毒(Papaya ringspot virus,PRSV)与番木瓜畸形花叶病毒(Papaya leaf distortion mosaic virus,PLDMV)存在混合感染的现象,近年来混合感染发病率逐年递增,是一种新的威胁番木瓜种植业的病毒病害。运用RT-PCR和RACE方法从混合感染样品中克隆获得2种病毒基因组全长c DNA,分别命名为PRSV-LM和PLDMV-LM,Gen Bank登录号分别为KT633943和KT633944,基因组序列大小分别为10 325、10 153 nt(不包括3′端的poly A)。序列分析表明:PRSV-LM与单独感染样品中的PRSV海南分离物HN(Gen Bank登录号:EF183499)的核苷酸序列和氨基酸序列相似性最高,为94%;PLDMV-LM与单独感染样品中的PLDMV海南分离物Hainan-DF(Gen Bank登录号:JX974555)核苷酸和氨基酸序列相似性最高,分别高达99%和97%。进化树分析显示,PRSV-LM和PLDMV-LM分别与单独感染样品的PRSV和PLDMV海南分离物有共同的进化起源。进一步利用实时荧光定量PCR对混合感染样品的PRSV与PLDMV病毒积累量进行分析,结果表明,混合感染样品中PLDMV病毒积累量大约是PRSV含量的100倍。研究结果为进一步探究PRSV/PLDMV混合感染发病机制奠定基础。
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