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猫杯状病毒全基因组的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 郑翠玲 1 ; 向华 1 ; 宣华 1 ; 王延树 1 ; 严悌昆 1 ;

作者机构： 1.广东省农业科学院兽医研究所

关键词： 猫杯状病毒;全基因组;克隆;序列分析

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2010 年 37 卷 03 期

页码： 109-111

收录情况： 北大核心

摘要： 采用RT-PCR和重组PCR扩增了猫杯状病毒(feline calicivirus,FCV)CH-GD株的全基因,并进行了序列测定,用DNAStar软件对其核苷酸序列和氨基酸序列进行比较分析。结果表明,首次分离于中国广东的CH-GD株与各参考毒株有较大的差异。CH-GD株与各参考毒株之间的同源性仅为75.4%~77.1%,明显低于各参考毒株之间的同源性(78.9%~99.9%)。同时遗传进化树显示,14个分离株形成两大分支,CH-GD株独自在一分支,各分离株无明显的地域性差异。对FCV衣壳蛋白6个区(A~F)的分析结果发现,CH-GD株中A~F区的特点与报道的相符。此外还发现,CH-GD株有3个区域的3个连续的氨基酸发生了变异,与参考毒株相比,CH-GD株在这3个区域的抗原性和亲水性也都发生了相应的变化。

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