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基于线粒体16S rRNA基因研究5个栉江珧野生群体的遗传多样性

文献类型： 中文期刊

作者： 严加坤 1 ; 杨爱国 2 ; 周丽青 2 ; 吴彪 2 ; 白临建 2 ; 刘志鸿 2 ;

作者机构： 1.上海海洋大学水产与生命学院

2.上海海洋大学水产与生命学院;农业部黄渤海渔业资源可持续利用重点开放实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词： 栉江珧(Atrina pectinta);16S rRNA;遗传多样性

期刊名称： 海洋科学

ISSN： 1000-3096

年卷期： 2013 年 37 卷 02 期

页码： 36-42

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用通用引物对山东长岛、文登、日照、广东湛江和海南三亚等5个地理群体栉江珧(Atrinapectinta)16S rRNA序列进行扩增、测序分析,得到59条441bp的核苷酸序列。其中T、C、A、G和A+T的平均含量分别为29.91%、17.41%、25.74%、26.94%及55.65%,AT含量高于GC含量,共检测到了9个单倍型和26个核苷酸多态位点。群体多样性分析表明,文登群体具有较高的遗传多样性水平。AMOVA分析表明,五群体间总遗传分化系数Fst=0.5007(P<0.001),群体间遗传分化略大于群体内、群体间存在较高的遗传分化。基于群体间遗传距离构建NJ和UPGMA分子进化树,5个地理群体的栉江珧聚为两个支,长岛、文登、日照群体聚为一支,海南和湛江群体聚为另一支。

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