您好,欢迎访问贵州省农业科学院 机构知识库!

辣椒4CL基因家族成员的鉴定与生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 何磊 1 ; 严希 1 ; 袁圆 1 ; 余伟 2 ; 李伟 3 ; 赖卫 1 ; 刘崇政 1 ; 杨红 1 ;

作者机构: 1.贵州省蚕业研究所

2.贵州省生物研究所

3.贵州大学农学院

关键词: 辣椒(Capsicum annuum);4CL基因家族;生物信息学分析;木质素

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2022 年 20 卷 008 期

页码: 2478-2484

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 4-香豆酸:辅酶A连接酶(4-coumarate:CoA ligase,4CL)基因家族调控植物木质素代谢、参与类黄酮和其他次生代谢产物合成.为了解辣椒Ca4CL基因家族的分子特性及生物学功能.本研究基于辣椒的全基因组测序结果鉴定4CL基因家族,并进行生物信息学分析.结果共鉴定获得8条辣椒4CL基因,不均匀的分布于基于3、7、11和12号染色体,其中Ca4CL06和Ca4CL08未锚定;辣椒Ca4CL的外显子数目在5~6之间,基序分析结果保守;分析顺式作用元件发现,在辣椒Ca4CLs上游2 000 bp序列中存在多个响应元件,包括光、Me-JA、厌氧诱导、低温等响应元件.辣椒4CL基因家族表达分析发现Ca4CL01在根、茎、叶、果皮(开花期后25 d,绿果期,转色期,转色10 d)、胎座(转色期,转色5 d,转色10 d)中均无表达,其余Ca4CLs表达具有较强组织特异性,Ca4CL04在叶、根、果皮等时期高表达.本研究为进一步分析Ca4CLs基因在生长发育、胁迫等条件下的功能和相应的信号转导途径提供了理论依据.

  • 相关文献

[1]复合型肥料对辣椒素及其相关次生代谢物质积累的影响与相关分析. 苏丹,蓬桂华,韩世玉,耿广东. 2016

[2]盐胁迫下胡萝卜肉质根中木质素响应机理研究. 陈皓炜,陈梦娇,王雅慧,张榕蓉,王欣蕊,徐志胜,谭国飞,熊爱生. 2021

[3]高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒JL株Nsp10基因生物信息学分析. 周思旋,徐健,周碧君,王开功. 2012

[4]杜仲BR受体蛋白基因EuBRI1克隆及生物信息学分析. 刘明月,赵懿琛,赵德刚. 2018

[5]百脉根PIN基因家族的鉴定与分析. 吕赟,丘日光,杨仕梅,吴佳海,宋莉. 2019

[6]抗草甘膦水稻突变体osgr-1 EPSPS基因克隆及生物信息学分析. 戴燚,赵德刚. 2018

[7]魔芋软腐病pelD和pelE基因的克隆与表达分析. 陈恩发,刘辉,丁海兵,潘牧,王启富. 2021

[8]杜仲EuDREB1基因的克隆及生物信息学分析. 杨玲玲,王磊,赵德刚,赵懿琛. 2018

[9]高羊茅FaGST1基因克隆、亚细胞定位及表达分析. 陈锡,赵德刚,陈莹,吴佳海,袁暘暘,王小利. 2020

[10]鸭坦布苏病毒贵州株分离鉴定及其E基因生物信息学分析. 徐景峨,胡成云,陈汝佳,李婷,张亚楠,余波,张雨梅,李林林. 2023

[11]萝卜开花基因RsFLC3的克隆与表达分析. 谭萍,罗小波,李亚东,彭潇,裴芸,杨光乾,金月月,祖贵东,田欢,张万萍. 2024

[12]芒果精氨酸脱羧酶基因MiADC的克隆及表达分析(英文). 刘荣,黄海,韩树全,范建新. 2018

[13]高粱SBP基因家族鉴定及干旱胁迫下的表达模式分析. 姜昱雯,陈满静,赵应,任艳,周棱波,沈佳奇,邵明波. 2024

[14]宽体金线蛭WpE基因的克隆及生物信息学分析. 程搏幸,卢昱希,匡诗涛,吴正关,田青青,邵贵燕,刘飞. 2022

[15]不同辣椒AT3(酰基转移酶3)基因的克隆表达与生物信息学分析. 吴媛,苏世贤,常媚瑕,汪淘,龙茶,韦金江,江苏燕,蓬桂华,何磊,袁远国,李伟. 2024

[16]贵州黑山羊ADD1基因克隆、生物信息学及组织表达规律研究. 杨洋,袁超,龙勇,肖文. 2024

[17]水稻核糖体失活蛋白家族基因OsRIP8的生物信息学与功能分析. 徐娅,黄佑岗,李树杏. 2024

[18]高羊茅FaFT2基因克隆及表达分析. 陈锡,赵德刚,陈莹,李小冬,吴佳海,王小利. 2017

[19]贵州黑山羊FAS基因CDS区的克隆与组织表达分析. 袁超,杨洋,韩勇,吴小敏,粟朝芝,王德凤. 2022

[20]COL1A1和COL1A2基因生信分析及其在梅花鹿不同组织中的表达谱. 杨远青,廖朝美,杨红,王正刚,袁超,杨洋,周明帅,赵佳福. 2024

作者其他论文 更多>>