文献类型： 中文期刊

作者： 赵银鸽 ¹ ; 袁欣 ¹ ; 高杰 ¹ ; 王慧娟 ¹ ; 李艳敏 ¹ ; 王晓晖 ² ; 师曼 ¹ ; 冯乃曦 ¹ ; 符真珠 ¹ ; 贾文庆 ³ ;

作者机构： 1.河南省农业科学院园艺研究所

2.洛阳农林科学院

3.河南科技学院园艺园林学院

关键词： 牡丹;ARF基因家族;生物信息学;基因表达

期刊名称： 河南农业科学

ISSN： 1004-3268

年卷期： 2024 年 53 卷 011 期

页码： 117-126

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究牡丹生长素响应因子（Auxin response factor,ARF）家族基因，对其基因家族进行鉴定，并对其进行生物信息学分析。结果表明，在牡丹岛锦、凤丹、洛神晓春中共鉴定出19个ARF基因，以拟南芥ARF基因家族进化分类为依据，将牡丹ARF基因家族成员分为4个亚族，根据系统发育树发现，牡丹与拟南芥的ARF同源基因存在密切的进化关系。不同牡丹ARF蛋白长度、等电点存在差异。所有PsARF均含有保守的B3和Auxin＿resp结构域，大部分PsARF还含有Aux/IAA结构域。保守基序分析表明，Motif数目为4～12个；基因结构分析显示，牡丹ARF基因内含子数量为1～19个；不同亚族间的Motif和内含子数目有一定的差异。组织表达特性分析显示，除PsARF2b在各个组织中不表达外，所有PsARF基因在牡丹组培苗根、茎、叶中均有表达，但在不同组织中的表达量存在很大差异，如PsARF7、PsARF19、PsARF8a、PsARF8b、PsARF6、PsARF11a、PsARF11b、PsARF9、PsARF16b、PsARF17、PsARFx在根中的表达量最高，PsARF5、PsARF3、PsARF4在茎中的表达量最高，而PsARF2a、PsARF1、PsARF16a、PsARF10在叶中的表达量最高。