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枸杞ISSR-PCR反应体系优化与遗传多样性研究

文献类型: 中文期刊

作者: 赵孟良 1 ; 任钢 2 ; 李屹 2 ; 任鹏鸿 2 ; 钟启文 3 ;

作者机构: 1.青海大学农林科学院;青海省蔬菜遗传与生理重点实验室;青海省海西州农科所

2.;青海大学农林科学院;青海省蔬菜遗传与生理重点实验室;青海省海西州农科所

3.;青海大学农林科学院;青海省蔬菜遗传与生理重点实验室;青海省海西州农科所;

关键词: 枸杞;ISSR-PCR;体系优化;引物筛选;遗传多样性

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2018 年 02 期

页码: 502-511

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为建立枸杞ISSR-PCR反应体系,通过单因子优化试验和L16(45)正交试验设计对相关参数进行了优化,其最优体系为20μL含Mg2+2.0 mmol/L、dNTPs 0.25 mmol/L、引物0.6μmol/L、Taq DNA聚合酶0.75 U、模板DNA 60 ng。对优化体系进行了稳定性检测,并从100条ISSR引物中筛选出12条,对7份枸杞资源进行了PCR扩增。实验结果表明,12条ISSR引物对7份枸杞种质资源共扩增出132个条带,其中多态性条带共123条,比率为93.2%;7份枸杞资源遗传距离分布在2.57~8.39,其中长辣椒与黑枸杞遗传关系最远;平均有效等位基因数为1.715 6,平均Nei's多样性指数为0.403 9,平均Shannon's指数为0.588 8。ISSR标记可用于枸杞遗传多样性研究。

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