文献类型： 中文期刊

作者： 黄秋芳 ¹ ; 孙敏华 ² ; 陈少莺 ³ ; 吕殿红 ⁴ ; 董嘉文 ⁵ ;

作者机构： 1.华南农业大学兽医学院广东省农业科学院兽医研究所广东省兽医公共卫生公共实验室福建省农业科学院畜牧兽医研究所

2.广东省农业科学院动物卫生研究所广东省兽医公共卫生公共实验室

3.福建省农业科学院畜牧兽医研究所

4.广东省农业科学院兽医研究所

5.华南农业大学兽医学院

关键词： 新城疫病毒;VIb亚型;基因组;序列测定;遗传分析

期刊名称： 华南农业大学学报

ISSN： 1001-411X

年卷期： 2012 年 33 卷 01 期

页码： 112-118

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据GenBank上发布的新城疫病毒基因组序列,设计了9对引物,对从福建福州地区发病半番鸭场分离的新城疫病毒FJ-SMD-03株进行了基因组cDNA扩增测序和分析.结果表明:FJ-SMD-03的基因组序列由15 192 nt组成,在NP基因非编码区比Lasota株多了6个核苷酸ACACTC;基因组由6个ORF组成,即3'-NP-P-M-F-HN-L-5'序列.BLAST结果显示:FJ-SMD-03基因组核苷酸与1.3、carrier-pigeon/Guangdong/2008、pigeon/Italy/1166/00、AV324/96和dove/Italy/2736/00相似性最高,达94.9%～98.5%;与疫苗株Lasota、Mukteswar和B1的相似性最低,为80.7%～83.3%;与我国标准强毒株F48E8及2002年从福建番鸭中分离到的基因VIId亚型强毒株Muscovy duck/China(Fujian)/FP1/02相似性较低,分别为82.5%和87.1%.F蛋白裂解位点的氨基酸序列为112 R-R-Q-K-R-F117,具有强毒株序列特征,进化树分析发现,FJ-SMD-03属于ClassⅡ类基因VIb亚型,证明鸭群中有VIb亚型NDV强毒株;FJ-SMD-03株NDV与1.3、carrier-pigeon/Guangdong/2008和pigeon/Italy/1166/00亲缘关系较近,与carrier-pi-geon/Guangdong/2008形成一个小的进化分支,推测FJ-SMD-03株与carrier-pigeon/Guangdong/2008和pigeon/Italy/1166/00株来源于共同的祖代毒株,可能与鸽携带的病毒有关.