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基于cDNA芯片的梨品种S基因型鉴定及新S-RNase基因进化分析

文献类型: 中文期刊

作者: 江南 1 ; 张琳 2 ; 谭晓风 2 ; 谭慧 2 ; 张靖国 3 ;

作者机构: 1.湖南工业大学包装与材料工程学院

2.中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室/经济林育种与栽培国家林业局重点实验室

3.湖北省农业科学院果树茶叶研究所

关键词: 梨;S-RNase基因;cDNA芯片;S基因型;进化分析

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2017 年 18 卷 03 期

页码: 520-529

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 梨品种S基因型鉴定对梨栽培中授粉品种选择和遗传育种都具有重要意义。本研究利用梨S-RNase基因荧光标记的特异引物PCR扩增获得梨品种荧光标记的cDNA特异产物;进一步完善梨S-RNase基因cDNA芯片,以被检测梨品种cDNA特异序列与梨S-RNase基因cDNA芯片杂交检测不同梨品种S基因型,并发现新的S-RNase基因。结果表明:利用梨S-RNase基因cDNA芯片鉴定了泸定王皮梨、兴山24号、弥渡百合等35个未知S基因型梨品种,确定了各品种的S基因型。结合PCRRFLP及DNA克隆和测序等技术,发现了7个新的S-RNase基因资源,获得了新S-RNase基因序列。序列分析表明各新S-RNase基因均具有S-RNase基因特异区域序列的典型特征;进化分析显示7个新S-RNase基因主要属于蔷薇科苹果亚科S-RNase类群,且存在种间和属间比种内和属内进化关系更近的现象。7个新的S基因分别命名为:PpS_(53)(Pyrus pyrifolia S53)、PpS_(54)、PpS_(55)、PpS_(56)、PpS_(57)、PpS_(58)和PpS_(59),GenBank登录号分别为:KX581753、KX581754、KX581755、KX581756、KX581757、KX581751和KX581752。

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