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高粱Dof基因家族鉴定及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 付森杰 1 ; 宋迎辉 1 ; 朱灿灿 1 ; 叶珍言 1 ; 秦娜 1 ; 代书桃 1 ; 刘海霞 2 ; 王春义 1 ; 李君霞 1 ;

作者机构: 1.河南省农业科学院粮食作物研究所

2.长葛市农业农村局

关键词: 高粱;Dof基因家族;转录因子;全基因组鉴定;PEG处理

期刊名称: 作物杂志

ISSN: 1001-7283

年卷期: 2025 年 001 期

页码: 54-65

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: DNA结合单锌指蛋白(DNA binding with one finger,Dof)是植物中特有的一类转录因子,参与调控植物组织分化、种子萌发、植物抗逆及代谢等生理生化过程。为鉴定并分析高粱Dof转录因子家族成员,利用生物信息学方法从全基因组水平对高粱Dof转录因子家族成员的基本基因结构、理化性质、保守基序、启动子顺式作用元件、组织特异性表达及干旱胁迫表达等进行分析。20%PEG6000模拟干旱胁迫处理豫粱10号的幼苗后,利用qPCR技术分析Dof基因家族成员响应不同时间段干旱胁迫的表达情况。结果共鉴定了30个高粱Dof基因,分布在9条染色体上,基因保守性分析结果显示,Motif1(即锌指结构)是高粱Dof基因家族中保守的蛋白质序列;其中29个基因中都含有CX2CX21CX2C保守基序,而SbDof15基因保守序列为CX20CX2C;启动子结构分析表明,Dof基因的启动子区域中含有ABA、MYB、MeJA、低温等逆境胁迫响应元件;进化树分析结果表明,高粱Dof蛋白与玉米的同源性更高,热图分析表明Dof家族成员在高粱的不同部位都有表达。qRT-PCR结果表明,高粱Dof基因家族成员可能参与高粱应对干旱胁迫的响应,不同的Dof基因成员在应对干旱胁迫时的调控机制可能不一样。

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