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白檀SRAP-PCR体系优化及引物筛选

文献类型： 中文期刊

作者： 安佰义 1 ; 于慧颖 1 ; 吴双 1 ; 刘晓嘉 1 ; 孙晓刚 1 ; 张艳 2 ;

作者机构： 1.吉林农业大学 园艺学院

2.吉林省农业科学院 农业生物技术研究所

关键词： 白檀;SRAP;体系优化;引物筛选

期刊名称： 北方园艺

ISSN： 1001-0009

年卷期： 2018 年 024 期

页码： 15-20

收录情况： 北大核心

摘要： 以白檀新生嫩叶为试材,通过单因素试验与正交实验,建立并优化白檀SRAP-PCR反应体系,对白檀SRAP反应体系中5个因素进行优化试验,并筛选SRAP引物组合,以期为今后SRAP分子标记在白檀上的应用提供依据.结果表明:各因素对SRAP-PCR扩增结果影响差异较大,依次为模板DNA>dNTPs>Mg2+>引物>Taq DNA聚合酶.最优反应体系为总体系10 μL体系中,Taq DNA聚合酶0.75U、dNTPs 0.1 mmol·L-1、Mg2+2 mmol·L-1、引物0.4 μmol·L-1以及模板DNA 80 ng.利用稳定的SRAP-PCR体系,从176对引物组合中筛选出25对多态性好的引物组合.在所建立的最优体系下,不同白檀基因组和不同引物组合均能稳定扩增,表明体系稳定可靠适用于白檀SRAP分子标记研究.

  • 相关文献

[1]朝鲜碱茅ISSR-PCR反应体系的建立与优化. 任伟,徐博,于洪柱,王志锋,徐安凯. 2011

[2]芒草ISSR分子标记体系的确定及引物的筛选. 徐博,刘沫含,王英哲. 2015

[3]紫花苜蓿细胞质雄性不育恢复基因的初步定位. 张世超,王英哲,金艳,陈晶晶,王莹,徐博. 2018

[4]山梨SSR反应体系的建立及其稳定性验证. 李红莲,王强,闫兴凯,张茂君. 2015

[5]朝鲜碱茅ISSR-PCR反应体系的建立与优化. 任伟,徐安凯,徐博,于洪柱,王志锋. 2012

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