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基于重测序鉴定GbTMEM214基因在陆地棉基因组的插入位点

文献类型: 中文期刊

作者: 程俊凌 1 ; 赵亮 2 ; 徐剑文 2 ; 刘剑光 2 ; 徐鹏 2 ; 徐珍珍 2 ; 郭琪 2 ; 王月平 1 ; 赵君 2 ; 沈新莲 2 ; 陈全家 1 ; 肖松华 2 ;

作者机构: 1.新疆农业大学农学院/棉花教育部工程研究中心

2.江苏省农业科学院经济作物研究所/农业农村部长江下游棉花与油菜重点实验室

关键词: 转基因棉花;GbTMEM214;重测序;插入位点;侧翼序列

期刊名称: 棉花学报

ISSN: 1002-7807

年卷期: 2024 年 36 卷 004 期

页码: 285-295

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】利用农杆菌介导法获得了转GbTMEM214基因陆地棉品系,旨在明确转基因棉花株系中T-DNA插入位点的序列特征及检测方法,为其生物安全评价提供依据。【方法】基于基因组重测序技术,利用BLASTn将测序数据与陆地棉TM-1基因组序列进行比对分析,设计特异性引物通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)验证插入位点。【结果】携带目标基因GbTMEM214的T-DNA整合在陆地棉基因组D13号染色体57 019 068~57 019 106 bp,T-DNA插入导致受体基因组37 bp的片段缺失;通过PCR扩增获得携带Gb TMEM214基因的T-DNA插入位点的侧翼序列,由此建立了转GbTMEM214基因棉花的特异性检测方法。【结论】基于基因组重测序技术获得了转Gb TMEM214基因棉花的T-DNA插入位点及侧翼序列信息,可为转基因棉花的生物安全评价提供技术参考。

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