您好,欢迎访问浙江省农业科学院 机构知识库!

浙江地区猪圆环病毒2型检测及遗传变异分析

文献类型: 中文期刊

作者: 徐丽华 1 ; 蓝胜芝 2 ; 余斌 1 ; 李军星 1 ; 张鹏超 2 ; 李宝臣 2 ; 苏菲 1 ; 袁秀芳 1 ;

作者机构: 1.浙江省农业科学院畜牧兽医研究所

2.浙江诗华诺倍威生物技术有限公司

关键词: 猪圆环病毒2型(PCV2);全基因组;ORF2基因;流行病学调查;遗传变异分析

期刊名称: 浙江农业学报

ISSN: 1004-1524

年卷期: 2020 年 32 卷 011 期

页码: 1970-1977

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了掌握浙江地区猪圆环病毒2型(porcine circovirus type 2,PCV2)流行病学特点和遗传变异情况,应用PCR检测方法,对2018年浙江地区猪场采集的临床疑似病料进行PCV2检测,并对部分阳性病料进行全基因扩增、克隆、序列测定和ORF2遗传进化树分析.结果显示:329份临床疑似样品中,PCV2阳性率27.4%(90/329),其中宁波地区阳性率最高,为52%;保育猪和肥育猪阳性率最高,分别为38.8%(64/165)和68.8%(11/16).选取7份病料进行全基因组扩增,每个毒株随机挑选3个或4个阳性克隆进行序列测定,共得到22个毒株进行遗传变异分析.22株病株同源性为93.3% ~99.8%,与16个参考毒株同源性为93.5% ~99.8%.根据遗传进化树分析,22个毒株分别处于3个分支,其中6株PCV2a,6株PCV2b,10株PCV2d,说明目前浙江地区PCV2d是优势毒株.ORF2遗传进化树分析显示,ORF2核苷酸同源性较全基因组核苷酸同源性低,3个分支分别处于PCV2b、PCV2d和PCV2e,预示浙江地区流行毒株可能在向PCV2e转变.本研究掌握了PCV2在浙江地区的流行动态,为浙江省PCV2疫苗株的选择和疫苗研发提供了理论依据.

  • 相关文献

[1]台州地区规模猪场主要疫病的流行病学调查. 徐丽华,陈冬祥,姚邦,候贤宏,游新根,管妙东,王一成. 2017

[2]2011—2017年浙江省猪病毒性腹泻病的流行病学调查. 徐丽华,李军星,苏菲,余斌,王赛,田瑞雨,袁秀芳. 2018

[3]浙江省某地区保育猪群呼吸道疾病综合征现场调查与诊治. 刘爱军,赵灵燕,李军星,周彩琴,张红丽,倪柏峰,黄晓兵,徐辉. 2019

[4]2014—2018年浙江省3种猪支原体流行病学调查. 徐丽华,兰胜芝,李军星,余斌,张鹏超,李宝臣,袁秀芳. 2019

[5]浙江省部分地区鸡球虫感染情况调查分析. 周思含,李天恩,邓金华,孙洪超,闫文朝,石团员,王天奇. 2024

[6]2008—2011年浙江省猪主要病毒性疫病病原流行病学调查. 徐丽华,王一成,袁秀芳,李军星,路斌,申世川,方维焕. 2012

[7]森林草莓全基因组WRKY转录因子基因的鉴定与分析. 苗立祥,张豫超,杨肖芳,蒋桂华. 2012

[8]大白菜WRKY转录因子的全基因组鉴定与分析. 蒋明,苗立祥,张豫超,管铭,潘小翠. 2013

[9]甜瓜全基因组WRKY转录因子基因的鉴定与分析. 苗立祥,蒋明,李建波,寿森炎. 2014

[10]长距离PCR法扩增RHDV全基因组及其序列分析. 张玉颖,刘光清,倪征,云涛,吴润,张淼涛. 2006

[11]马口鱼全基因组简单重复序列特征分析与多态性标记开发. 葛健辉,关文志,任晋东,牛宝龙,胡金春,王伟,翁旭东,楼宝,于瑾,许晓军. 2023

[12]甜瓜全基因组WRKY转录因子基因的鉴定与分析. 苗立祥,蒋明,李建波,寿森炎. 2014

作者其他论文 更多>>