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4种鳕鱼线粒体16S rRNA、COI和Cyt b基因片段序列的比较研究

文献类型: 中文期刊

作者: 毕潇潇 1 ; 高天翔 1 ; 肖永双 1 ; 李永振 2 ;

作者机构: 1.中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室

2.中国水产科学研究院南海水产研究所

关键词: 鳕鱼;16S rRNA基因;COI基因;Cyt b基因;序列分析

期刊名称: 南方水产

ISSN: 1673-2227

年卷期: 2009 年 5 卷 03 期

页码: 50-56

摘要: 对狭鳕(Theragra chalcogramma)、太平洋鳕(Gadus macrocephalus)、蓝鳕(Micromesistius poutassou)和远东宽突鳕(Eleginus gracilis)4种不同属鳕鱼的线粒体16S rRNA、Cytochrome oxidase subunit I(COI)和细胞色素b(Cytb)基因片段序列进行了测定,分析比较了不同鳕鱼种间的序列差异。通过PCR扩增和序列测定,得到4种鳕鱼线粒体3个基因片段的总长度分别为539bp(16S rRNA)、601bp(COI)和385bp(Cytb),其基因片段的A+T含量都较高。4种鳕鱼种内个体间序列变异较小,3个基因片段的核苷酸替代速率依次为Cytb>COI>16S rRNA。Cytb基因片段序列的分析结果显示太平洋鳕和狭鳕间分歧时间约为219万年,发生于中新世(Mio-cene);宽突鳕与蓝鳕间分歧时间约为653万年,发生在上新世(Pliocene)。根据遗传距离构建的NJ系统树表明,狭鳕与太平洋鳕的亲缘关系较近,与蓝鳕的亲缘关系较远。

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