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葡萄热激转录因子分类及其相关SSR标记分析

文献类型： 中文期刊

作者： 杨海波 1 ; 张华丽 2 ; 梁芳 2 ; 秦贺兰 2 ; 王茂良 2 ; 辛海波 2 ;

作者机构： 1.山西省农业科学院果树研究所

2.北京市园林科学研究院/绿化植物育种北京市重点实验室

关键词： 葡萄;热激转录因子;SSR;分子标记

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2016 年 32 卷 10 期

页码： 157-161

收录情况： CSCD

摘要： 热害是目前葡萄设施生产中存在的主要问题之一。作为耐热性的主要调控因子,HSF的分析及其基因序列中分子标记研究对葡萄耐热相关育种具有重要意义。通过植物基因组数据库Phytozome(http://phyto5.phytozome.net/)下载19条葡萄热激转录因子(heat shock factor,HSF)蛋白序列,并对各HSF的氨基酸数目、分子量和等点电进行了预测。以拟南芥HSF为参照,经过多序列比对和进化树分析,对葡萄HSF进行序列分析和分类,发现葡萄基因组中HSF有10个A类、7个B类和2个C类。同时,分析了19条HSF基因序列中SSR(simple sequence repeats)位点,并设计特异引物,以‘赤霞珠’基因组DNA为模板,通过PCR(polymerase chain reaction)对引物有效性进行验证。结果表明,葡萄基因组内包括3类HSF因子编码基因,它们的序列上存在SSR位点,可用于分子标记的开发。研究结果为葡萄耐热相关分子辅助育种提供了参考。

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