文献类型： 中文期刊
作者： 姜翠翠 1 ; 方智振 1 ; 周丹蓉 1 ; 林炎娟 1 ; 叶新福 1 ;
作者机构： 1.福建省农业科学院果树研究所
关键词： 李;基因组;糖转运;基因家族;鉴定;生物信息学;表达分析
期刊名称： 园艺学报
ISSN： 0513-353X
年卷期： 2022 年 49 卷 002 期
页码： 252-264
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 基于'芙蓉李'(Prunus salicina)基因组数据,采用生物信息学分析方法鉴定糖转运蛋白家族基因,并对其蛋白质理化特性、亚细胞定位、系统进化树、蛋白质保守结构域以及表达模式进行分析.共鉴定出49个该家族基因,根据保守结构域和系统发育分析将其分为7个亚家族.蛋白质介于313~948个氨基酸之间,预测定位于质膜或液泡膜;所有的蛋白都含有保守的糖转运体结构域(PF00083),其中大多数含有12个跨膜螺旋.通过比对'芙蓉李'果实发育过程的RNA-seq数据,对49个基因进行表达谱分析,其中15个在果实不同发育阶段差异表达;qRT-PCR分析表明,15个差异表达基因中有9个基因与果实葡萄糖和蔗糖含量显著正/负相关,其中1个肌醇转运蛋白亚家族基因(PsINT4)、1个糖转运蛋白亚家族基因(PsSTP11)、1个糖促进蛋白亚家族基因(PsSFP5)和1个液泡单糖转运蛋白亚家族基因(PsTMT1)在'芙蓉李'果实发育过程中具有较高的表达量,可能在'芙蓉李'果实发育和成熟过程中对糖分积累起重要作用.
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