文献类型： 中文期刊

作者： 吴娴 ¹ ; 王倩 ¹ ; 吴朝昕 ¹ ; 阙涛 ² ; 吴钱蓉 ³ ; 龙武华 ¹ ; 彭强 ¹ ; 朱速松 ¹ ;

作者机构： 1.贵州省水稻研究所

2.贵州师范大学生命科学学院

3.贵州大学生命科学学院

关键词： 香稻;遗传多样性;液相芯片

期刊名称： 四川农业大学学报

ISSN： 1000-2650

年卷期： 2025 年 43 卷 001 期

页码： 104-110

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]分析贵州香稻资源的群体结构与遗传多样性,促进贵州香稻在育种中的应用.[方法]利用50K液相基因芯片对78份香稻材料、2份不香的贵州培育品种、粳稻对照日本晴、籼稻对照9311共82份进行全基因组基因型检测,开展遗传多样性研究.[结果]经过严格过滤,获得35 344个高质量SNP位点,期望杂合度平均为0.328 2;最小等位基因频率平均为0.216 6;Nei's基因多样性指数平均为0.328 2,标记缺失率平均为0.004 0;Shonnon指数平均为0.506 0;PIC值平均为0.271 4,大于0.250 0的SNPs位点占比达78.59%,说明获得的SNPs标记具有较高的多态性和可信度.群体结构分析表明,有66份资源遗传背景相对比较单一,但材料的少数遗传成分具有多源性;82份水稻资源可被划分为6个亚群,贵州香禾材料共分为3类,说明遗传背景存在差异;而贵州培育香稻与9311聚为一类,多为籼稻材料.[结论]遗传参数结果说明贵州香稻品种间的位点遗传多样性较高,遗传多样性分析表明贵州香禾是一类特殊的香稻,且组间有很好的区分度,遗传背景存在差异;贵州培育香稻多为籼稻材料.