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朱顶红SRAP-PCR反应体系的建立和优化

文献类型: 中文期刊

作者: 孙翊 1 ; 张永春 2 ; 殷丽青 2 ; 杨柳燕 2 ; 李心 2 ; 费如桂 3 ;

作者机构: 1.上海市农业科学院林木果树研究所

2.;上海市农业科学院林木果树研究所

3.;上海市农业科学院林木果树研究所;

关键词: 朱顶红;SRAP;反应体系优化;正交设计

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2017 年 05 期

页码: 1806-1813

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究采用L_(16)(4~5)正交试验设计方法,对朱顶红SRAP-PCR反应体系中的5种因素(Mg~(2+)浓度,d NTPs浓度,引物浓度,DNA模板量和Taq DNA聚合酶用量)进行优化,结果表明各因素对朱顶红SRAP-PCR扩增反应影响大小依次为:d NTPs浓度>引物浓度>Mg~(2+)浓度>DNA模板量>Taq DNA聚合酶用量。优化获得的朱顶红最佳SRAP-PCR反应体系为:1×PCR Buffer、Mg~(2+)浓度2.0 mmol/L、d NTPs浓度0.2 mmol/L、引物浓度0.25μmol/L、20μL体系中DNA模板量80 ng以及Taq DNA聚合酶用量0.5 U。用10个朱顶红品种基因组DNA对所得最优体系进行验证,证明该体系具有较高的稳定性和重复性,能够为朱顶红遗传多样性研究和遗传图谱构建等提供重要技术支持。

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