文献类型： 中文期刊
作者： 付璐璐 1 ; 李思琦 2 ; 甄毓 3 ; 米铁柱 4 ;
作者机构： 1.中国海洋大学海洋生命学院
2.青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室
3.海洋环境与生态教育部重点实验室
4.中国海洋大学环境科学与工程学院
关键词： 厌氧氨氧化细菌;16S rRNA基因;群落结构;丰度
期刊名称： 中国海洋大学学报(自然科学版)
ISSN： 1672-5174
年卷期： 2019 年 09 期
页码： 77-88
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为比较厌氧氨氧化细菌16S rRNA基因的2对特异性引物(Amx368F/Amx820R、Brod541F/Amx820R)在其分子生态学研究方面的优点与不足,本研究采用高通量测序和qPCR技术对长江口及其邻近海域沉积物中厌氧氨氧化细菌细菌的群落组成、多样性和丰度进行比较分析,结果表明,引物Amx368F/Amx820R特异性较高,能够较为完整地反映沉积物中厌氧氨氧化细菌的多样性信息,且其覆盖的厌氧氨氧化细菌丰度与功能基因hzo丰度正相关(P<0.01);而引物Brod541F/Amx820R特异性较低,覆盖部分厌氧氨氧化细菌及其他多个门的细菌,其量化的厌氧氨氧化细菌与功能基因hzo丰度无明显相关关系(P>0.05)。因此,引物Amx368F/Amx820R能够更加真实地反映厌氧氨氧化细菌在海洋沉积物中的群落特征,在其分子生态学研究中更具优势。
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