文献类型： 中文期刊

作者： 庄静 ¹ ; 周熙荣 ² ; 孙超才 ² ; 管帮超 ³ ; 彭日荷 ⁴ ; 乔玉山 ¹ ; 章镇 ¹ ; 高峰 ⁴ ; 蔡斌 ⁴ ; 熊爱生 ⁴ ; 姚泉洪 ⁴ ;

作者机构： 1.南京农业大学园艺学院

2.上海市农业科学院作物育种栽培研究所

3.上海市崇明县农业技术推广中心

4.上海市农业科学院生物技术研究所

关键词： AP2/ERF;转录因子;克隆;生物信息学;甘蓝型油菜;沪油15

期刊名称： 中国生物工程杂志

ISSN： 1671-8135

年卷期： 2008 年 28 卷 05 期

页码： 29-40

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： AP2/ERF转录因子家族是植物中广泛存在的一类转录因子,AP2/ERF这类转录因子主要参与植物的细胞周期、生长发育以及生物和非生物胁迫相关基因的表达调控。由于拟南芥和油菜同属于芸薹属,具有相似的基因信息,利用油菜UniGene数据库,以拟南芥ERF转录因子保守序列为探针,通过电子克隆从一个UniGene C luster中分离得到三个同类的AP2/ERF转录因子,从cDNA序列、氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性分析、序列比对、进化树、功能域、二级结构、三级结构、无序化特性进行了预测和较为全面的分析。结果显示油菜来源的BnaERF1、BnaERF2和BnaERF3属于AP2/ERF转录因子的B-2亚族,是亲水性蛋白,在蛋白质的三级结构上与AtERF1相似。蛋白质无序化分析发现,油菜BnaERF1、BnaERF2和BnaERF3无序化程度小于拟南芥AtERF1。设计引物通过PCR和RT-PCR方法分别从甘蓝型双低油菜沪油15幼苗的DNA和cDNA中扩增了上述基因,初步分析BnaERF2没有内含子,BnaERF1和BnaERF3有内含子。另外,通过EST丰度分析显示,该类转录因子的表达最高峰在种子中,其次为花,在芽、茎和分生组织中没有检测出表达的存在。