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亚麻FAD基因家族的生物信息学鉴定分析

文献类型： 中文期刊

作者： 侯静静 1 ; 赵利 1 ; 王斌 1 ;

作者机构： 1.甘肃省农业科学院作物研究所

关键词： 亚麻;FAD基因家族;生物信息学分析

期刊名称： 寒旱农业科学

ISSN： 1001-1463

年卷期： 2023 年 2 卷 003 期

页码： 246-253

摘要： 不饱和脂肪酸为人体提供基本代谢所必需的能量,须从膳食中补充.脂肪酸去饱和酶FAD(fatty acid desaturase)是植物不饱和脂肪酸合成途径中的关键酶,植物体内脂肪酸的各组分比例和不饱和度与FAD的去饱和作用息息相关.为探究亚麻FAD基因家族的表达与进化,为其在亚麻高品质育种中的应用提供理论依据.运用生物信息学方法对亚麻全基因组FAD基因家族的43个LuFADs基因进行分析.结果显示,该家族成员编码的蛋白质大小为152~453个氨基酸,大部分为碱性不稳定亲水蛋白.与拟南芥FADs蛋白序列构建系统发育树,可分为4个主要亚家族:Δ12/ω-3去饱和酶、"前端"去饱和酶、Δ7/Δ9去饱和酶和SAD去饱和酶.保守结构域和外显子-内含子结构分析得出,同一亚组中的家族成员具有较为相似的基因结构.染色体定位分析呈随机性分布.亚细胞定位预测得出,叶绿体上的家族成员最多.启动子顺式作用元件分析发现,该家族成员中抗氧化反应元件(ARE)数量最多.

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