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烟草基因组中AGO蛋白的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 蔡健宇 1 ; 武晓云 2 ; 郭玉双 3 ; 李翔宇 1 ;

作者机构： 1.浙江农林大学农业与食品科学学院贵州省烟草科学研究院烟草行业分子遗传重点实验室黑龙江省农业科学院作物研究所

2.浙江农林大学农业与食品科学学院

3.贵州省烟草科学研究所

关键词： 生物信息学;烟草;Argonaute(AGO);分子结构;功能预测

期刊名称： 江西农业学报

ISSN： 1001-8581

年卷期： 2017 年 29 卷 02 期

页码： 1-8

摘要： 对在NCBI上登录的烟草AGO蛋白(argonaute proteins)的信息进行了整理,并对其组成成分、系统发育树、信号肽、跨膜结构域、细胞定位、亲水性/疏水性、蛋白质的二/三级结构等进行了预测和分析。结果表明:在烟草基因组中共有22个AGO蛋白,可分为8类;烟草的AGO蛋白与拟南芥的AGO一样在进化上分为3个分支,其编码的蛋白是一个无跨膜结构域、无信号肽/导肽的亲水性蛋白,α-螺旋散布于整个蛋白质中,具有PAZ和PIWI两个特征结构域。此外,烟草的AGO2/4/7/16/PNH1定位在细胞核中,AGO10定位在细胞质中,AGO5定位在线粒体中。

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