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后基因组时代下作物的SNP分型方法

文献类型： 中文期刊

作者： 赵琼一 1 ; 李信 2 ; 周德贵 3 ; 何飞 4 ; 周少川 3 ; 罗达 1 ;

作者机构： 1.中国科学院上海植物生理生态研究所

2.上海交通大学

3.广东省农业科学院水稻研究所

4.上海生物芯片有限公司

关键词： 单核苷酸多态性;作物;SNP分型

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2010 年 8 卷 01 期

页码： 125-133

收录情况： CSCD

摘要： 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)是生物体最普遍的一种多态差异,在植物功能基因组研究和作物遗传改良方面有着广泛的应用。利用全基因组水平SNP标记谱进行遗传变异的研究、群体结构分析、关联性分析、作物分子设计育种,以及对大规模SNP数据进行验证、评估等,都迫切需要发展和利用各种不同的SNP分型手段实现。本文综述了目前常用的一些SNP分型方法,简要介绍了检测原理及操作流程,并对后基因组时代下作物的高通量SNP数据的分析进行了讨论。

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