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月季NBS-LRR-RGAs的分离与鉴定

文献类型: 中文期刊

作者: 张非亚 1 ; 杜运鹏 2 ; 刘瑞峰 1 ; 袁晓娜 1 ; 张冬梅 3 ; 贾桂霞 1 ;

作者机构: 1.花卉种质创新与分子育种北京市重点实验室

2.北京农业生物技术研究中心

3.上海市园林科学规划研究院

关键词: 月季;黑斑病;NBS-LRR-RGAs

期刊名称: 北京林业大学学报

ISSN: 1000-1522

年卷期: 2016 年 38 卷 11 期

页码: 89-96

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: RGAs已经在很多植物中得到分离与克隆,它往往是R基因或者是R基因的一部分。为了分离与鉴定与月季抗黑斑病相关的RGAs,在转录组数据基础上,设计简并引物6对,从现代月季、疏花蔷薇、‘白玫瑰’上分离克隆了NBS-LRR-RGAs,挑取750个克隆进行序列分析。从系统发育树可以看出:所克隆的RGAs与已克隆的其他植物的R基因具有较近的亲缘关系,分为non-TIR-NBS-RGAs和TIR-NBS-RGAs 2个大类,10个进化枝,其中所克隆得到的non-TIR-NBS-RGAs的比例远大于TIR-NBS-RGAs的比例;氨基酸序列比对发现所克隆的RGAs均含有完整的NBS结构域P-Loop、kinase-2、kinase-3a和GLPL;通过进化树对不同家族的6个RGAs的表达分析可看出,它们都不同程度、不同时间地参与了抗病反应。

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