文献类型： 中文期刊
作者： 李丽华 1 ; 郭颖彬 2 ; 魏昕 1 ;
作者机构： 1.河南省农业科学院粮食作物研究所
2.济宁技师学院
关键词： 禾本科植物;系统进化;NAC基因家族;干旱胁迫;玉米;基因表达
期刊名称： 干旱地区农业研究
ISSN： 1000-7601
年卷期： 2022 年 40 卷 004 期
页码： 230-237
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 利用生物信息学方法,对4个禾本科物种玉米、高粱、二穗短柄草和水稻的NAC基因家族进行鉴定和系统进化分析.结果表明:4个禾本科物种共556个NAC基因可以聚类为6个进化枝;物种内NAC转录因子有相似的理化性质,但在进化枝上又表现出差异,进化枝1、2、3和进化枝4、5、6分别表现出相似的相对分子质量,进化枝1、2、3、5表现出相似的等电点,进化枝4、6表现出相似的等电点;4个物种共鉴定出27个含跨膜结构域的NAC基因,并且大部分(88.9%)都位于进化枝4上;使用溯源法共鉴定出174个禾本科祖先基因,每个物种NAC基因丢失和保留都存在差异;基因复制分析发现,串联复制对禾本科NAC基因家族扩张贡献明显(20.3%,113/556),而玉米的大片段复制事件对玉米NAC基因家族扩张贡献明显(30.5%,50/164);干旱胁迫下玉米转录表达分析鉴定出51个差异表达基因,且不同组织内的差异表达基因数目存在差异,叶和雌穗内的差异表达基因数目多于雄穗.
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