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RACE法分离团头鲂生长抑素全长cDNA及其序列测定

文献类型： 中文期刊

作者： 俞菊华 1 ; 夏德全 1 ; 杨弘 1 ; 贺艳辉 1 ; 陈勇军 1 ; 吴婷婷 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心

关键词： 团头鲂;快速扩增cDNA末端;生长抑素;分离

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2003 年 27 卷 06 期

页码： 31-37

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 生长抑素具有抑制脑垂体GH释放的作用,是调控鱼类生长的主要激素之一。本研究采用RT和RACE(rapid amplification of cDNA ends)法,分离和测定了团头鲂脑中生长抑素PSSI cDNA的全长核苷酸序列,并对该基因进行了结构和系统进化分析。3’RACE扩增得到700bp左右的片段,5’RACE分离得到500bp左右的片段,把3’片段与5’片段拼接得到全长cDNA。cDNA全长735bp[不含poly(A)],5’端非翻译区有100nt,3’端290bP[不包含poly(A)],阅读框(open reading frame,ORF)345bp。该序列与金鱼PSSI cDNA序列同源性为90％,主要差异在5’端非翻译区。团头鲂生长抑素mRNA阅读框编码114个氨基酸,包括一些酶切位点,产生26个氨基酸的大分子态生长抑素,进一步加工成与人等结构相似的14个氨基酸的生长抑素;团头鲂生长抑素前体氨基酸序列与金鱼、虹鳟、鲶鱼、鮟鱇、蛙、牛、鼠、鸡、猴、人等的比较发现,它与金鱼的同源性最高达95％,与鮟鱇最低50％,与人68％。这说明生长抑素基因在长期的进化中相当保守,同时,也因为鱼类生活环境多样导致基因变异较大。

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