您好，欢迎访问湖北省农业科学院 机构知识库！
湖北省农业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

禽巴氏杆菌四环素耐药株转录组测序与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孔令严 1 ; 汪最 1 ; 邵华斌 1 ; 张腾飞 1 ; 卢琴 1 ; 罗青平 1 ;

作者机构： 1.湖北省农业科学院畜牧兽医研究所;农业部畜禽细菌病防治制剂创制重点实验室

关键词： 禽源多杀性巴氏杆菌;转录组测序;GO功能分析;KEGG功能分析;ARDB注释

期刊名称： 中国动物传染病学报

ISSN： 1674-6422

年卷期： 2019 年 01 期

页码： 30-36

收录情况： 北大核心

摘要： 为鉴定禽源多杀性巴氏杆菌(avian Pasteurella multocida,Pm)四环素(Tetracycline,Tet)敏感株与耐药株(MIC=32μg/mL)在转录组水平上的差异,本研究采用RNA-seq技术对Tet敏感株与耐药株进行双向测序,通过GO、KEGG和ARDB数据库对表达差异基因进行注释和富集性分析。结果显示,共筛选出442个差异表达基因,其中包括103个上调基因和339个下调基因。通过GO功能富集分析显示差异表达基因多数富集于核糖体结构成分、rRNA结合、跨膜运输和离子转运等生物过程;对差异表达基因进行信号通路富集性分析,大多数差异表达基因分布在ABC转运蛋白与核糖体代谢途径中;对差异表达基因进行耐药基因注释(ARDB),发现其中的耐药基因主要为核糖体保护蛋白和外排系统两类。本研究表明禽源Pm对四环素耐药的耐药机制可能与细胞膜上ABC转运蛋白的过量表达以及核糖体保护蛋白有关。

  • 相关文献

[1]禽巴氏杆菌链霉素耐药株转录组测序与分析. 汪最,孔令严,邵华斌,卢琴,罗青平. 2018

[2]禽巴氏杆菌环丙沙星耐药株转录组测序与分析. 孔令严,罗青平,卢琴,邵华斌,李槿年. 2017

[3]体外诱导禽巴氏杆菌链霉素耐药株及耐药机制的初步分析. 汪最,孔令严,邵华斌,卢琴,罗青平,杨玉莹. 2018

[4]体外诱导禽巴氏杆菌环丙沙星耐药株及耐药机制的初步分析. 孔令严,李槿年,卢琴,邵华斌,罗青平. 2017

[5]基于RNA-seq技术的茶树CsbHLH62生物信息学分析. 曹丹,金孝芳,马林龙,刘艳丽. 2018

[6]基于盐胁迫转录组信息的蚕豆F-box基因家族分析. 郝树琳,陈宏伟,廖芳丽,李莉,刘昌燕,刘良军,万正煌,沙爱华. 2020

[7]基于RNA-seq技术的茶树CsbHLH62生物信息学分析. 曹丹,金孝芳,马林龙,刘艳丽,郭桂义. 2019

[8]桃响应葡萄座腔菌侵染的转录组学分析. 刘勇,王富荣,王会良,艾小艳,朱炜,孙中海,吕亮,龚林忠,何华平. 2024

[9]转录组测序技术在猪繁殖与呼吸综合征病毒研究中的应用. 梁婉,周丹娜,彭忠,杨克礼,段正赢,郭锐,刘威,吴斌,陈文杰,孟丽,田永祥. 2019

[10]80份绿豆象抗感蚕豆种质资源SSR遗传多样性分析. 孙虎,刘昌燕,李莉,刘良军,韩雪松,万正煌,沙爱华,陈宏伟. 2023

[11]鸡EGFR基因的功能分析及其对颗粒细胞中基因表达的影响研究. 陈林,王家乡,吴艳,皮劲松,蒲跃进. 2025

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：湖北省农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台