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谷子waxy基因exon2-exon4区间序列比对分析

文献类型： 中文期刊

作者： 陈晓敏 1 ; 李书田 2 ; 杨自力 3 ; 孙宇燕 1 ; 刘斌 2 ;

作者机构： 1.内蒙古农业大学农学院

2.赤峰市农牧科学研究院

3.内蒙古赤峰市农牧科学研究院

关键词： 谷子;waxy;序列比对

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2015 年 13 卷 01 期

页码： 98-105

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了明确中国春谷子waxy基因序列的变异,本研究以引进的53份谷子品种(系)为材料,采用PCR产物测序,对waxy基因exon2-exon4序列进行比对分析。研究结果显示:非糯、低直链淀粉含量和糯质类型频率分别为22.6%、54.7%和9.4%;在非糯类型中,11、12、22、23号材料检测到碱基缺失和置换,1、13、18和27号仅存在碱基缺失;在低直链淀粉类型中,9、17和24号同时存在碱基插入、缺失和置换,14和15号品种为碱基缺失和置换,大红谷(00009836)为碱基插入和缺失,20号和43号仅分别出现置换和缺失;在糯质类型中,红粘谷(00000537)同时检测到碱基插入、缺失和置换,杏黄粘存在缺失和置换。根据exon2-exon4区间序列变异,以阈值为78将53份材料聚为十大类,其中第一类品种数量较多,第五类群SNP多态性较丰富。

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