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多枝赖草基因组Mb级DNA制备和酶切方法的优化

文献类型: 中文期刊

作者: 徐粤宇 1 ; 周玉雷 2 ; 赵茂林 3 ; 王志平 4 ; 王克武 4 ; 张艳 1 ;

作者机构: 1.首都师范大学

2.甘肃农业大学

3.北京市农林科学院

4.北京市土肥工作站

关键词: 多枝赖草;Mb级DNA;基因组文库;脉冲交变电场电泳;酶切

期刊名称: 华北农学报

ISSN: 1000-7091

年卷期: 2007 年 22 卷 06 期

页码: 24-29

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: Mb级DNA的制备和酶切是构建YAC,PAC,BAC,BIBAC和TAC文库与大尺度物理图谱的基础。以浓度0.4%(m/m)NaCl人工模拟盐池中生长的多枝赖草再生叶为材料提取细胞核,经钢丝细胞筛过滤,多次回收滤渣和离心上清中的细胞核,相差显微镜调浓度达108个/mL后,经LMP包埋,蛋白酶K降解核蛋白,脉冲电泳纯化回收后,在LMP胶块中2 Mb以上DNA的浓度约为250 ng/μL。在胶中经Hind III部分酶切再用脉冲电泳回收不同大小范围的DNA,电洗脱浓缩除盐后浓度约为25 ng/μL。用此方法得到的核DNA不但无细胞器DNA等的污染,而且浓度高,可直接用于各种人工染色体文库的构建。

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