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单细胞转录组测序技术发展及其在甘薯中的应用

文献类型: 中文期刊

作者: 赵楠 1 ; 梁雪莲 1 ; 谢淑燕 2 ; 张新新 2 ; 马婷婷 2 ; 邹宏达 2 ; 陈景益 2 ; 房伯平 2 ; 黄立飞 2 ;

作者机构: 1.仲恺农业工程学院农业与生物学院

2.广东省农业科学院作物研究所广东省农作物遗传改良重点实验室

关键词: 单细胞转录组测序;甘薯育种;细胞异质性

期刊名称: 西北农林科技大学学报(自然科学版)

ISSN: 1671-9387

年卷期: 2023 年 51 卷 003 期

页码: 39-50,61

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术是在单个细胞水平通过对mRNA进行高通量测序研究其整体水平基因表达情况的一项新技术.本研究概述了 scRNA-seq技术的发展历程和创新;详细介绍了 scRNA-seq技术的单细胞捕获/分选、反转录/PCR扩增、建库测序和测序数据基础分析等步骤,以及在植物单细胞图谱、非生物胁迫响应机制、细胞分化发育、转录因子调控网络等研究中的应用;剖析了该技术在甘薯中单细胞图谱、分化、抗逆和基因方面的应用潜力;最后对该技术的应用进行了展望.

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