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羊口疮病毒强弱毒株免疫相关基因的比较分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张艳敏 1 ; 丁学东 1 ; 马园 1 ; 张静 2 ; 吉鹏华 2 ; 王国华 3 ; 潘相臣 3 ; 刘冬冬 3 ; 田普厚 3 ; 石顺利 4 ; 张七斤 1 ;

作者机构: 1.内蒙古农业大学兽医学院

2.内蒙古自治区农牧业科学院

3.内蒙古必威安泰生物科技有限公司

4.内蒙古通辽市家畜繁育指导站

关键词: ORFV;免疫相关基因;系统进化树;同源性分析

期刊名称: 畜牧与饲料科学

ISSN: 1672-5190

年卷期: 2020 年 005 期

页码: 96-106

摘要: 通过对采集到的青岛市某发病羊场羊口疮病料(强毒)在山羊成纤维细胞上连续传90代(弱毒)后,分别进行病毒基因组提取,并对提取到的基因组分别命名为ORFV-QD和ORFV-RD.根据GenBank上发表的ORFV全基因组序列设计并合成3对特异性引物,分别扩增ORFV-QD和ORFVRD的B2L基因、F1L基因和VIR基因片段,并将扩增得到的基因组片段分别克隆到pMD-19T载体上,转化到DH5α感受态细胞中,对重组质粒进行鉴定后送至测序公司进行测序,用DNASTAR软件对测序结果进行拼接及3组基因之间核苷酸同源性比较分析,将测序结果与NCBI上已公布的13组ORFV全基因组相应基因核苷酸序列进行同源性比对分析、构建系统进化树及氨基酸序列比对分析.结果表明,3组基因与参考序列的B2L基因、F1L基因和VIR基因核苷酸同源性分别为92.1%~98.4%、96.1%~99.1%和94.6%~100%.将2株病毒基因组与参考序列进行氨基酸序列比较分析,结果显示2株病毒基因组之间并没有较为明显的差异.

  • 相关文献

[1]蒙古马和纯血马免疫相关基因差异表达分析. 任秀娟,康德措,苏少锋,蔺雅楠,李雅静,杜明,白东义,李蓓,赵一萍,芒来. 2023

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