文献类型： 中文期刊
作者： 庞强强 1 ; 蔡兴来 1 ; 孙晓东 1 ; 张文 1 ; 周曼 1 ;
作者机构： 1.海南省农业科学院蔬菜研究所
关键词： 大白菜(Brassica campestris L.);TPS基因家族;生物信息学;高温胁迫;表达分析
期刊名称： 分子植物育种
ISSN： 1672-416X
年卷期： 2020 年 008 期
页码： 2452-2459
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为明确大白菜TPS (BrTPS)家族成员信息及对高温胁迫信号的响应,本研究利用生物信息学方法,在大白菜基因组数据库中鉴定了BrTPS基因家族成员,并对其理化性质、进化特征、蛋白结构及在高温胁迫下的表达模式进行分析.结果表明,大白菜全基因组含有15个TPS基因家族成员,分布于8条染色体上.除BrTPS14和BrTPS15外,其余成员各含有1个TPS和1个TPP结构域,并且所含motif的排列顺序也完全一致.理化性质分析发现,15个成员的氨基酸长度介于129~1 459 aa之间,分子量大小在14.73~165.83 kD之间,大部分BrTPS蛋白为酸性蛋白和亲水蛋白,以无规则卷曲作为二级结构主要构成元件.进化分析表明,大白菜TPS基因家族成员可分为2类,其中ClassⅠ包含5个成员,ClassⅡ包含10个成员.本研究对高温胁迫前后不同组织和持续高温胁迫下叶片中的表达分析,发现大部分的BrTPS基因可对高温胁迫产生响应,但在表达规律上存在差异.这些研究结果为后续研究大白菜TPS基因提供一定参考.
- 相关文献
[1]菜心BrHsfA3基因克隆及其对高温胁迫的响应. 庞强强,孙晓东,周曼,蔡兴来,张文,王亚强. 2023
[2]基于转录组的荔枝GRF基因家族的鉴定及表达分析. 阮城城,胡福初,王祥和,吴凤芝,周文静,吴文碟,周瑞云,陈哲. 2021
[3]芒果中性/碱性转化酶MiNI基因的克隆与表达分析. 郭利军,邓会栋,冯学杰,罗志文,陈哲,范鸿雁,胡福初,华敏. 2020
[4]荔枝多胺氧化酶(PAO)基因家族的全基因组鉴定与表达分析. 唐丽雯,张月,岳晓琦,丁峰,胡福初,周开兵,马武强. 2023
[5]荔枝RAV家族转录因子的全基因组鉴定及表达分析. 岳晓琦,杨成坤,张月,唐丽雯,胡福初,王祥和,丁峰,马武强,周开兵. 2022
[6]不同快菜品系萌发期耐热指标筛选及耐热性评价. 庞强强,孙晓东,蔡兴来,张文,周曼. 2021
[7]菜心耐热性评价及酶促抗氧化系统对高温胁迫的响应. 庞强强,周曼,孙晓东,张文,蔡兴来. 2020
[8]不同菜心品种萌发期和苗期耐热性分析及其鉴定指标筛选. 庞强强,周曼,孙晓东,陈贻诵,蔡兴来. 2020
[9]南瓜热激蛋白相关基因CmHSP70-5的克隆和高温胁迫下的表达分析. 胡艳平,周扬,杨春,廖道龙,朱白婢,王敏,黄文枫,张文,云天海. 2019
[10]高温胁迫下茄子qRT-PCR内参基因筛选及稳定性分析. 李植良,罗少波,陈日远,金庆敏,黎振兴,李德明,孙保娟,孙光闻. 2017
[11]菜心叶片响应高温胁迫的转录组分析及转录因子筛选. 庞强强,孙晓东,周曼,蔡兴来,陈贻诵,王亚强. 2024
[12]菠萝R2R3-MYB基因家族鉴定与表达分析. 陈哲,胡福初,阮城城,范鸿雁,郭利军,张治礼. 2019
[13]南瓜HSP70蛋白家族的鉴定和生物信息学分析. 胡艳平,周扬,云天海,朱白婢,王敏,张文. 2019
[14]菠萝MADS-box基因家族的生物信息学分析. 胡加谊,陈哲,胡福初,罗志文,年宇薇,何凡,张治礼. 2017
[15]巴西橡胶树LIM结构域基因克隆与生物信息学分析. 吴瑞,朱家红,张全琪,张治礼. 2010
[16]定安鹅IGF1基因克隆及生物信息学分析. 叶保国,张小辉,徐铁山,谢亮. 2012
[17]乙烯利诱导菠萝成花过程中FT基因的克隆与表达分析. 阮城城,年宇薇,胡福初,王祥和,范鸿雁,吴凤芝,陈哲,张治礼. 2019
[18]菠萝COL基因的克隆及响应乙烯的表达特性分析. 阮城城,胡福初,王祥和,郭利军,李玉静,范鸿雁,罗志文,陈哲,张治礼. 2021
[19]菠萝TCP基因家族的鉴定及成花诱导阶段的表达谱分析. 阮城城,胡福初,罗志文,王祥和,郭利军,李玉静,范鸿雁,韩冰,陈哲,张治礼. 2020
[20]荔枝GA2ox基因家族的鉴定及表达分析. 陈哲,王祥和,周文静,周瑞云,吴文碟,吴凤芝,范鸿雁,胡福初. 2021
作者其他论文 更多>>
-
基于灰色系统理论对少花宽叶十万错不同时期营养品质的评价
作者：庞强强;蔡兴来;周曼;孙晓东
关键词：少花宽叶十万错;不同时期;营养品质;评价
-
海南樱桃番茄品质与土壤养分和肥料投入量的关系
作者：雷菲;张文;符传良;陈庭勇;谭皓;刘国彪;潘孝忠
关键词：樱桃番茄;品质;养分投入;土壤养分;相关性
-
海南夏季蔬菜高效生产技术规程
作者：尚庆茂;张锋;吴华瑞;廖道龙;罗丰;孙晓东;庞强强;伍壮生;陈贻诵
关键词：夏季蔬菜;抗病丰产;南菜北运;生产技术规程;夏季高温;集约化育苗;病虫害;自给率
-
番茄青枯病对海南不同质地砖红壤肥力的影响
作者：李海鹏;易伟鹏;孙晓东;曹启民;黄月华;孙楚涵
关键词：理化性质;酶活力;土壤肥力;青枯病
-
对黄曲条跳甲高毒力Bt菌株的鉴定及田间药效评价
作者：边强;于淑晶;孙晓东
关键词：黄曲条跳甲;苏云金杆菌;毒力测定;田间防效
-
菜心叶片响应高温胁迫的转录组分析及转录因子筛选
作者：庞强强;孙晓东;周曼;蔡兴来;陈贻诵;王亚强
关键词：菜心;高温胁迫;转录组;差异表达基因;转录因子
-
基于游离小孢子培养的菜心DH系评价
作者：庞强强;孙晓东;周曼;蔡兴来;王亚强;施国宾
关键词：菜心;DH系;园艺性状;综合评价
