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嗜水气单胞菌诱导的中华鳖SMART cDNA文库构建及相关基因的鉴定

文献类型： 中文期刊

作者： 李伟 1 ; 朱阿莉 2 ; 史燕 3 ; 朱新平 4 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所

2.农业部热带亚热带水产种质资源利用与养殖重点实验室

3.上海海洋大学水产与生命学院

4.南京农业大学无锡渔业学院

关键词： 中华鳖;嗜水气单胞菌;cDNA文库;免疫相关基因

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2014 年 33 卷 04 期

页码： 81-88

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以致病性嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)人工感染的中华鳖(Trionyx sinensis)心、肝、脾、肾为材料,应用SMART技术(switching mechanism at 5'end of RNA transcript)构建了嗜水气单胞菌感染组织的cDNA文库。将获得的cDNA片段连接到PGEM-T载体,然后电转化进入大肠杆菌DH5α感受态细胞中,PCR阳性检测结果显示插入片段在0.5~2 kb之间。该库含有4.3×105个重组子,重组效率为92%,本实验分析鉴定了164个≥1000bp的片段,39个序列在中华鳖中首次发现,鉴定的基因包括免疫基因11个;信号转导基因6个:催化类基因15个;转运相关基因3个;结构基因7个;未知基因9个。本实验文库的成功构建,不仅鉴定了中华鳖机体与细菌感染相关的免疫基因,同时为深入展开免疫学、系统发育和病原与机体的互作研究奠定了良好基础。

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