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玉米BURP家族基因的鉴定和分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张中保 1 ; 吴忠义 1 ; 魏建华 1 ;

作者机构： 1.北京市农林科学院生物中心/北京市农业基因资源与生物技术重点实验室

关键词： 玉米;BURP结构域;顺式作用元件;表达模式

期刊名称： 玉米科学

ISSN： 1005-0906

年卷期： 2014 年 22 卷 03 期

页码： 36-42

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用玉米基因组数据库,通过生物信息学手段鉴定玉米BURP家族基因的全序列、定位和编码蛋白,通过序列比对进行进化和分类分析,利用玉米高通量芯片表达数据进行组织表达谱分析。结果表明,玉米基因组中含有10个BURP家族基因,分布于玉米的5条染色体上,该10个基因通过选择性剪切编码14个BURP蛋白。启动子分析表明,大部分BURP家族基因的启动子区均含有逆境应答及花粉和种子发育顺式作用元件。各个发育阶段中,多数成员在生殖器官及营养器官中均有较高的表达量,只有ZmBURP3仅在营养器官根、茎、叶中高表达,ZmBURP2仅在生殖器官雄蕊和花粉中高量表达。实时荧光定量PCR结果表明,ZmBURP3、ZmBURP4基因受PEG和NaCl胁迫处理诱导不同程度上调表达。

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