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巴西橡胶树SNARE蛋白全长cDNA克隆及其序列特征分析

文献类型： 中文期刊

作者： 邓柳红 1 ; 罗明武 2 ; 张春发 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

2.华南热带农业大学

关键词： 巴西橡胶树;胶乳;SNAREs蛋白;Ykt6

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2007 年 33 卷 05 期

页码： 826-830

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 从巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)差减cDNA文库中筛选到一个与SNARE蛋白同源性较高的基因片段,根据其序列信息设计特异引物,采用cDNA末端快速扩增技术RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)进行差异片段的5′和3′端的扩增,获得了长度为1 070 bp的全长cDNA克隆R295。序列分析表明该基因包含600 bp的开放阅读框,5′-UTR为93 bp,3′-UTR为377 bp,编码199个氨基酸。该基因编码的蛋白具有一个SNARE coiled-coil保守区、一个典型的VAMP基元及一个羧基端的CAAX基元。同源分析表明该蛋白属于一类特殊的longins蛋白。RT-PCR检测表明它在胶乳中特异表达,在叶中没有表达。

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