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西瓜抗病毒病种质资源SSR分子标记及其遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 高宁宁 1 ; 李晓慧 1 ; 康利允 1 ; 常高正 1 ; 梁慎 1 ; 徐小利 1 ; 李海伦 1 ; 王慧颖 1 ; 赵卫星 1 ;

作者机构: 1.河南省农业科学院园艺研究所

关键词: 西瓜;遗传多样性;SSR;抗病毒病;分子标记

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2022 年 20 卷 004 期

页码: 1239-1249

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 研究西瓜抗感病毒病种质间的遗传多样性和亲缘关系,以提高西瓜抗病毒病新品种选育效率.本试验从50对SSR引物中筛选出12对多态性高且稳定的引物,对51份抗感病毒病西瓜种质进行简单重复序列标记(SSR)分析,共获得187个稳定且清晰的条带,其中多态性条带142个,多态率可达75%.供试西瓜种质的观测等位基因数(Na),有效等位基因数(Ne),Nei's基因多样性指数(H)和Shannon's信息指数(Ⅰ)分别为1.759 4、1.289 9、0.185 4、0.296 1.供试西瓜种质的遗传相似系数的范围在0.50~0.94之间,遗传差异系数小,表明SSR分子标记能够区别遗传变异小的种质.以遗传系数0.78为界,UPGMA聚类可将51份供试西瓜种质分为5大类,抗病毒病型西瓜种质主要集中在第Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ大类,感病型西瓜种质主要集中在第Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ大类,野生抗病毒病西瓜种质均分布在第Ⅰ大类,表明抗病毒病型野生西瓜种质与其他种质间的亲缘关系最远.Cophentic相关性检验的遗传相似性原始数据矩阵与UPGMA聚类结果矩阵相关系数值R为0.825,说明SSR分子标记能够准确地分析供试西瓜种质间的差异.供试抗病毒型西瓜种质的遗传多态性高于感病型西瓜种质,供试西瓜种质总体的遗传多样性不够丰富,要拓展西瓜抗病毒病种质资源的遗传基础,需要加强遗传差异大的新种质的收集和利用.

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