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无核荔枝生长素反应因子基因克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘兴地 1 ; 莫坤联 2 ; 郑楷 1 ; 郑学勤 1 ; 李明芳 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

2.海南大学

关键词： 无核荔枝;ARF;克隆;序列分析

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2013 年 29 卷 07 期

页码： 111-116

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为获得在无核荔枝中胚珠退化过程中差异表达的生长素反应因子基因(ARF),对其全长的克隆并进行分析,根据构建的无核荔枝胚珠败育SSH消减文库的生长素反应因子EST序列,提取高质量的RNA,通过SMART-RACE技术,获得一个生长素反应因子3501bp的核苷酸序列。应用生物信息学软件进行分析,预测该序列含有2550bp的开放阅读框,推导的蛋白质为849个氨基酸,具有B3、Auxin_resp和AUX_IAA保守区与结构功能域。分析表明该基因为ARFs基因家族中的一个新成员,进化树上与芒果亲缘关系最近。

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