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基于SSR标记的花菜类种质亲缘关系和群体遗传结构分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘春晴 1 ; 李光庆 2 ; 姚雪琴 2 ; 蔡杰 2 ; 谢祝捷 3 ;

作者机构: 1.上海市农业科学院园艺研究所国家蔬菜改良上海分中心上海市设施园艺技术重点实验室

2.;上海市农业科学院园艺研究所国家蔬菜改良上海分中心上海市设施园艺技术重点实验室

3.;上海市农业科学院园艺研究所国家蔬菜改良上海分中心上海市设施园艺技术重点实验室;

关键词: 花菜;SSR;遗传多样性;聚类分析;群体结构;关联分析

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2018 年 04 期

页码: 1327-1337

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用SSR标记,选用41对带型清晰的多态性引物,对145个花菜类品种和资源材料进行遗传多样性分析。共检测到274个多态性位点,每组合的多态性条带数从3~17之间,平均为7.0。利用NTSYS-pc2.10e软件采用Jaccard’s相似系数和UPGMA方法进行聚类分析。结果表明,通过群体遗传结构分析将供试材料分为4个亚群。大部分具有亲缘关系的品种依青花菜、松花菜、紧花菜和芥蓝各聚为一类群,其结果与花菜形态学分类具有高度的相符性;145个品种的平均遗传相似系数为0.77,变化范围在0.59~0.99之间,青花菜、紧花菜和芥蓝品种间的平均相似系数均为0.81,松花菜为0.88,类群内品种间的遗传多样性较低。以GLM分析,发现28个与熟性相关联的标记,各标记对表型变异的解释率在0.041 8~0.210 8;以MLM分析,发现8个与熟性相关的标记,各标记对表型变异的解释率在0.041 5~0.073 2。这些标记主要位于C2、C5和C9染色体。

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