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三种自然变异构树的转录组学分析初探

文献类型： 中文期刊

作者： 任媛媛 1 ; 梁超 2 ; 王哲 3 ; 王文君 1 ; 王念 1 ; 翟晓巧 1 ;

作者机构： 1.河南省林业科学研究院

2.河南省林业资源监测院

3.平顶山大学

关键词： 构树;树皮颜色;转录组;分析

期刊名称： 河南林业科技

ISSN： 1003-2630

年卷期： 2024 年 44 卷 003 期

页码： 17-19

摘要： 构树在我国分布广泛，变异度高，野生构树在各地由于气候地理条件的差异在树皮类型上发生变化，优良性状亟待挖掘，其分子和遗传学研究较少。研究中，使用第2代测序和全长转录组测序来发现白树皮、红树皮和条纹树皮构树之间的差异。共鉴定了9 172个全长转录本，94.86%的全场转录组序列从至少一个数据库中成功注释。共检测到43 475个基因，进行了3次比较，上调的差异基因与蛋白激酶信号通路-植物和植物病原体的相互作用有关，下调的差异基因参与光合作用、抗坏血酸和阿糖代谢。部分序列的表达水平通过定量实时PCR法得到进一步验证。这些发现初步阐明了白皮、红皮和条纹皮构树在转录水平上的差异，为构树新品种育种奠定了基础。

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