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'玛瑙红'樱桃胚败育果实和正常果实比较转录组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 宋莎 1 ; 江旭升 2 ; 金吉林 1 ; 张绿萍 1 ; 张敏 1 ;

作者机构： 1.贵州省农业科学院果树科学研究所

2.贵州省贵阳市农业试验中心

关键词： ‘玛瑙红’樱桃;胚败育;差异表达基因;转录组测序

期刊名称： 种子

ISSN： 1001-4705

年卷期： 2024 年 43 卷 010 期

页码： 43-48,53

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探索‘玛瑙红’樱桃在胚败育情况下果实仍正常发育的分子机理，本研究采用Illumina高通量测序技术，对不同发育时期的‘玛瑙红’樱桃胚败育果实和正常果实样品进行转录组测序及相关分析。结果共获得98.87%的Clean Reads, 86.24%的Mapped Reads, Q30>94.21%;共筛选出43 673个差异表达基因，其中所有样品组合共有的差异表达基因为8 213个，大多分布在FPKM 0～0.01区间。富集分析显示，注释到GO的差异表达基因参与分子功能、细胞组分、生物过程等，其中参与生物过程的最多；注释到KEGG通路的差异表达基因分别参与环境信息处理、生物体系统、遗传信息处理、细胞过程和新陈代谢五大通路的18个分支，大多注释到新陈代谢通路；预测为转录因子的差异表达基因共2 002个，共注释到53个转录因子家族，其中ERF家族最多。研究表明，‘玛瑙红’樱桃胚败育果实与正常发育果实在膨大期基因表达差异较大，果实转色期至果实成熟基因表达差异逐渐变小，这可能是胚败育果实正常成熟的原因。

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