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猪lncRNA2099互作蛋白的筛选与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张冬杰 1 ; 马守正 1 ; 汪亮 1 ; 刘娣 1 ;

作者机构： 1.黑龙江省农业科学院畜牧研究所

关键词： 猪;长链非编码RNA2099;前脂肪细胞;RNA pull down;质谱分析

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2025 年 003 期

页码： 43-46

收录情况： 北大核心

摘要： 为了鉴定新发现的一个长链非编码RNA2099(lncRNA2099)的互作蛋白，试验使用体外培养的猪前脂肪细胞，PCR扩增获得带T7启动子的lncRNA2099体外转录用模板，通过RNA pull down、蛋白质银染及质谱分析的方法对可能与lncRNA2099互作的蛋白进行了筛选与分析。结果表明：PCR扩增和体外转录成功获得了带有生物素标记的lncRNA2099和反义链探针，以反义链探针为阴性对照，lncRNA2099在体外培养的脂肪细胞中共下拉出132个互作蛋白，去掉与阴性对照相同的86个蛋白后，获得46个特异蛋白。根据得分排名，与lncRNA2099互作的蛋白分别是膜联蛋白A2(ANXA2)、肌球蛋白重链2(MYH2)、Y-box结合蛋白(YBX1)和α微管蛋白(α-Tubulin)。说明RNA pull down技术联合质谱分析技术，可鉴定出新发现的lncRNA的互作蛋白。

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