文献类型： 中文期刊
作者： 严婉荣 1 ; 肖敏 1 ; 陈圆 1 ; 曾向萍 1 ; 赵志祥 1 ;
作者机构： 1.海南省农业科学院植物保护研究所海南省植物病虫害防控重点实验室
关键词： 芽孢杆菌;16S rRNA;特异性基因
期刊名称： 基因组学与应用生物学
ISSN： 1674-568X
年卷期： 2017 年 11 期
页码： 4686-4692
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为了研究10种芽孢杆菌的基本特性,下载到70条芽孢杆菌属细菌的16S r RNA序列,通过对比芽孢杆菌的基本特征和16S r RNA序列种内和种间相似性,发现基本特征很难区分这10种菌株。16S r RNA序列种内相似性最高为100%,最低的是B.amyloliquefaciens,种内分化较明显,最低值为90.85%,种间相似性最高的2个菌株是B.subtilis strain 168和B.amyloliquefaciens strain BCRC 11601,最高值为99.66%,最低为92.01%。B.subtilis、B.amyloliquefaciens、B.anthracis、B.cereus、B.methylotrophicus、B.atrophaeus之间某些菌株的16S r RNA相似性极高,通过16S r RNA序列很难区分,B.coagulans的16S r RNA特异性最好。同时本研究提供了gyr A、gyr B、rpo A、yya R、yya O等多个能够准确鉴定的特异性基因,为快速鉴定菌种提供了便利。
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